认识自然有两种手段，一种是哲学的思辨，一种是科学的观察，哲学可以为科学提出原理，指明科学发展的方向，科学则可以验证这些原理并为新原理的提出提供新的依据，两者是相辅相成、缺一不可的。可在实际的西方科学发展过程中，由于还原论的巨大成功，科学家们开始相信用精密仪器可以帮助人类认识自然界的一切，于是哲学这种认识自然的手段被抛弃了，而没有了哲学的指导，物理学就走向了神秘主义和不可知论。
今天的西方科学，看起来富丽堂皇，其实却处处充满着神秘主义的气息，这就是抛弃了科学的基石——物质的相互作用，而用凌驾在物质之上的方程式用描述自然界的一切。以往我们研究物质世界，都是探索什么物质作用于什么物质，而在今天，物质不灭的哲学定律被否定，能量成了世界的唯一，而能量无形无象、无所不在，用它可以造出自然界的一切，这显然就是”上帝“形象的回归。更有甚者，冷静的科学家们竟然否定微观世界的因果关系，引入了不可思议的”自由意志“，这还是当年那个探索自然最普遍规律的科学吗？
科学产生这一切混乱的原因其实只有一个，那就是抛弃了哲学，或者说用时髦哲学来代替真正的哲学。哲学之所以有价值，就是因为自然内在的统一性，这种统一性告诉我们，人和万物一样，不仅由同一种物质组成，也由同一个原理支配，因此，人存在与发展的原理就是万物存在与发展的原理，认识了自己存在与发展的规律，就认识到了万物存在与发展的规律，哲学就是通过认识自我存在与发展的规律来认识万物存在与发展规律的一门学问。
显然，哲学并不是空洞的猜想，而是建立在自然统一性的基础上，它根据万物在运动原理上的统一性，通过系统间类比的方法来认识万物。有了这种方法论，我们就可以通过宏观系统来认识微观系统，从可观察的系统现象来认识不可观察的系统现象，从而得到对自然更本质的认识。
西方科学认识自然的手段是通过精密仪器，这本质上是忽视了物质彻底的统一性。因为如果物质是彻底统一的，那么组成精密仪器的物质和所有被观测的对象本质上就是一样的，用它只能观测由统一物质组织起来并出现个性的东西，而对共性的统一物质的混沌状态是永远不可观察的。也就是说，迷信精密仪器，就忽视了隐藏在精密仪器背后的物质世界。
就拿中医和西医来说吧！虽然它们表面上看起来矛盾重重，其实真正的区别只有两个，一个是人与自然的关系，一个是整体与局部的关系。西医观察不到人与自然的关系，就以为疾病和自然变化没有关系；观察不到整体与局部的关系，就以为疾病和整体没有关系，结果，疾病的原因被单调归于细胞的病变之上。而中医呢？则来自于哲学的思辨，它通过人体系统与地球系统的类比，不但认识到大自然变化是通过作用于人体的水来影响人体的（类比潮汐效应），而且人体的能量循环主要也是靠水来实现的（类比地球表面的能量循环），经络学说就是基于这种认识得到的，它是对人体组织液循环通道的一种描述。正是认识到了人与自然的关系，以及整体与局部的关系，才得到了疾病的外因是人与自然的矛盾激化，内因则是由于不平衡引起的整体管理失控，中医本质上就是一门恢复整体管理的学问，因为在中医看来，只要恢复了整体的管理，病变细胞就会在整体力量的控制下改邪归正。
有点哲学头脑的人一比较就知道，中医的疾病观是更科学的，西医的疾病观不仅忽视了人与自然的关系，而且忽视了整体与局部的关系，注定是不完善的，“治病必求于本”，如果疾病的原因都认识错了，它有可能正确治疗吗？大量疑难病症的出现已经证明了这一点。
科学是用来探索自然最普遍规律的，而不是用来掷骰子玩的。自然界最普遍的现象是什么？当然是呈系统的秩序，科学的目的就是为了探索这个支配自然秩序的必然性规则，用来指导人的生存。可西方科学呢？至今也无法解释自然秩序的存在，甚至连生命是什么都不知道！更可笑的是，科学家们竟然被表象所迷惑，开始否定必然性规律的存在，用什么”掷骰子的概率“来解释自然界的一切。要知道，必然性是科学的灵魂，否定了必然性，科学的灵魂就没了，研究它的意义何在呢？
西方科学的问题出在哪呢？答案其实很明显，那就是前提假设错了！在一个错误的前提假设之上再努力也是发现不了真理的。看看这个前提假设就知道了，它不仅忽视了物质在空间中的连续性，使生命问题不可认识，而且忽视了物质彻底的统一性，使普遍联系不可认识，这都是西方科学的死穴！要想解决现代科学的难题，方法只有一个，那就是在一个更符合自然事实的前提假设之上对西方科学进行重建！
在这里，中国的气一元论就是一个更符合自然事实的前提假设，中国的先人就是用统一的一种物质（气）的有序和无序变换的规律来解释自然界的一切。如吸引和排斥的矛盾，当物质从无序向有序转化就会产生吸引现象，当物质从有序向无序转化就会产生排斥现象。再如自然力，它本质上只有一种，那就是物质之间紧张地相互压迫，它之所以出现多种自然力，则是因为自然界的层次，一种普遍联系方式对应着一种自然力，也对应着一个物质层次。
用一种物质（气）、一个原理（阴阳变换的规律）来解释自然界的一切，初看起来不可思议，但其实却包含着深刻的辩证法。事实上，物理学的发展也不断证实，只要坚持物质的统一性，物理学就能够取得良性的发展，只要违背了物质的统一性，物理学就停滞不前，中国的气一元论是彻底的一元论思想，无疑是指导科学取得突破的基石。
随着我们对中国气一元论假设的深刻认识，一场更伟大的科学革命已经呼之欲出，因为有了一个更符合自然事实的前提假设，一个完整的系统科学体系就建立了，用它不仅可以解释自然界的一切系统现象，而且可以根据它推导出大量未知的自然现象，推动自然科学一场革命！让我们拭目以待吧！
