服务器centos版本为7.4.1708，但R版本停留在3.6.0多年，痛定思痛需要更新。
- 做好原有路径备份，将/usr/bin/R备份为/usr/bin/R.3.6.0，/usr/bin/Rscript备份为/usr/bin/Rscript.3.6.0，/usr/share/R备份为/usr/share/R.3.6.0/
- 更新服务器cairo及libxt相关库文件，部分无法下载成功的可能需要手动下载后上传安装
yum install cario* libxt*
yum install readline-devel - 从R的官网下载.tar.gz包，上传服务器后解压
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http://www.bubuko.com/infodetail-2679820.html
命令：cd R-3.5.1 (切换至解压后的目录)
命令：mkdir -p /home/work/R351（创建新的工作目录）
命令：./configure --prefix=/home/work/R351 --enable-R-shlib （设置R的工作目录，完成后无错误则继续 ）
开始编译安装
命令：make
命令：make install（执行过程中可能报各种错误，一般是缺少依赖，安装即可，见后附）
安装生产环境中正在运行的实例所需要的包
命令：vim ~/.bash_profile （配置环境变量，在打开的文件中修改R路径，原来是"PATH=/home/work/R/bin:PATH
命令：source ~/.bash_profile （使修改生效）
完成操作后执行： R （能正常进入R命令行则正常 )
检查正在运行实例的运行状况。
升级Rstudio
wget https://download2.rstudio.org/server/centos7/x86_64/rstudio-server-rhel-2022.02.1-461-x86_64.rpm
sudo yum install rstudio-server-rhel-2022.02.1-461-x86_64.rpm
rstudio-rserver restart升级X11
yum install xorg-x11-* libX11-* libXt-*在Rstudio中Global Options-General-Graphics, Backend设定为Cairo
yum install https://extras.getpagespeed.com/release-latest.rpm
yum install libicu libgfortran5* glibc zlib
下载https://sourceforge.net/projects/libpng/files/libpng16/1.6.37/libpng-1.6.37.tar.gz
tar zxvf libpng-1.6.37.tar.gz
cd libpng-1.6.37/
mkdir /usr/local/bin/libpng-1.6.37/
./configure --prefix=/usr/local/bin/libpng-1.6.37
make
make install
ln -s /usr/local/bin/libpng-1.6.37/lib/libpng16.so.16.37.0 /usr/local/lib/libpng16.so.16
ln -s /usr/local/bin/libpng-1.6.37/lib/libpng16.so.16.37.0 /usr/local/lib/libpng16.so
ln -s /usr/local/bin/libpng-1.6.37/lib/libpng16.so.16.37.0 /usr/local/bin/R-4.1.3/lib64/R/lib/libpng16.so.16
如使用BiocManager安装包提示无法连接
Warning: unable to access index for repository http://mirrors.utsc.edu.cn/bioc/packages/3.14/bioc/src/contrib:
cannot open URL 'http://mirrors.utsc.edu.cn/bioc/packages/3.14/bioc/src/contrib/PACKAGES'
更改设置
options(BioC_mirror="http://mirrors.ustc.edu.cn/bioc")
