公元前399年，苏格拉底被雅典民主法庭宣判死刑。罪名是不敬神和败坏青年。
这是人类历史上最黑暗的一页，一个用他的哲学思想劝诫人们过美好生活的人，竟然被他的同胞给杀害了。这说明雅典虽然是哲学的圣地，却不是哲学家的乐园。
出身于本邦的哲学家只有两个，苏格拉底被处死，他的学生、年轻的哲学家柏拉图逃亡于国外。
这又是人类历史上最光荣的一页，一个人宁死不放弃探索真理的权利，为哲学殉情，证明了人的精神所能抵达的高度。
据说在审判之初，无论是原告还是雅典市民，都未必想置苏格拉底死地。他们更希望苏格拉底屈服，向他们认个错，今后不再聚众谈论哲学。可是苏格拉底并不买他们的帐，他偏不示弱，以他一向的风格从容为自己辨论。平淡中带着讥讽，雄辨中带着诙谐。
投票的结果以281票对220票宣告他有罪。当时，要想逃避死刑，就是接受一定数额的罚款。但是苏格拉底说他没有钱，他只付得起一个银币。他的学生柏拉图等人劝他认罚，并表示愿意替他出三十个银币，但被他拒绝了。
判决之后，苏格拉底作最后发言，他说：“我缺的不是言辞，而是厚颜无耻，哭哭啼啼，说你们爱听的话。你们习惯于看别人这样，但是这种事不配我做。逃死不难，逃罪恶难，罪恶追人比死快。我又老又纯，所以被跑慢的追上，你们敏捷，所以被跑快的追上。我们各受各的惩罚。”
然后，苏格拉底又讽刺那些判官说：我儿子长大后，如果关注钱财先于德行，没出息而自以为有出息，请责备他们，一如我责备你们。分手的时候到了，我去死，你们去活，谁的去路好，唯有神知道。
据说，宣判之后他的学生柏拉图曾劝苏格拉底逃跑，被他所拒绝了。他说：民主是我主张的，现在民主投票判处我死，我宁愿接受这个判决。我如果跑了将没有人再相信真理。
据说，在苏格拉底死后，雅典人后悔了。他们给他立了雕像，并且驱遂了诬告他的安尼图斯，处死了判他死刑约美勒托。
柏拉图在老师死后曾致辞说：“在我们所认识的人中，他是最善良、最有智慧、最正直的人。“
的确，不管人们对他的学说如何评价，都不能不承认他为后世树立了人生追求和人格上的典范。在古希腊哲学史上，他是为捍卫真理而死的第一人。
