主要使用TBtools的gene location visualize from GTF/GFF
1719405392138.png
第一个文件gff3或者gtf,拖进来就行
第二个文件,要展示的gene ID,弄个空白txt,复制上去就行
第三个文件好像是一行写两个基因,表示不同拷贝
第四个文件是颜色分组,就一个txt文件,第一列基因ID,第二列RGB颜色,逗号分隔
第五个文件是重命名基因ID
第六个文件是基因密度(用TBtools的gene density profile,输入GFF3/GTF文件,设置一下输出位置就可以了)
有第一个文件第二个文件就可以生成了