进行细胞系STR鉴定是很重要的。很多生物医药的研究都采用培养细胞来进行,这些细胞可能是受赠于其它研究人员,也可能是从细胞库(如美国 ATCC,American Type Culture Collection)得来。据估计,15-20%的实验室,实验中所使用的细胞已经不是原来的细胞系,或者与其它细胞系发生了交叉污染。显然,细胞系遭到污染、特征鉴别错误,将会极大的威胁着基于这些细胞而发表的论文质量和研究发现的正确性。
什么情况下需要细胞系鉴定?
1. 当建立或获得一个新的细胞系时;
2. 一个涉及到细胞试验项目开始/结束时;
3. 在细胞冻存之前,或细胞已连续培养 2~3 个月时;
4. 发表文章或申请课题经费前;
5. 细胞系表现不稳定或结果与预期差别较大时;
6. 当实验室使用超过一种细胞系时,所有细胞系最好先鉴定以排除交叉污染的可能。
如何根据STR数据判断细胞系身份?
收到细胞系鉴定结果以及 STR 信息,可以与参考数据库进行比对。如果细胞样本的每个 STR 位点和参考细胞 STR 位点都能重合匹配,即说明该细胞系正确,反之则说明你的细胞系可能被错误标记,交叉污染或发生遗传不稳定。一般说来,匹配度≥80%即可认为该细胞系正确,匹配度<80%则说明该细胞系的来源需要被怀疑。
如果细胞系被鉴定出发生交叉污染或错误标记,则需要拿更早代数的细胞进行鉴定,从而找到问题的起源或者直接从可靠的机构购买一株新的细胞系。