R安装
Rstudio安装：
- 下载安装包
进入Rstudio官网下载Rstudio Desktop。
选择自己电脑对应的系统版本下载。
- 点击安装。
Rstudio中如何更新R：
mac用户
mac用户更新分两步。
- 从CRAN下载最新的R pkg，安装后重启Rstudio。可以看到R version已经更新。
- 转移已经安装的R包
/Library/Frameworks/R.framework/Versions/x.xx/Resources/library
x.xx为旧的版本号，换到新的版本号。
注意新的版本文件夹下已经存在的包不要替换了。如果替换了看第3步
路径可通过installed.packages()查看。 - 更新所有转移的包
update.packages(checkBuilt=TRUE) - 查看是否成功
version
用packageStatus查看目前所有包的情况。packagestatus对象包含两个表，一个是inst，即从library文件夹检测所有包目前的情况；一个是avail，是从CRAN站点看所有可安装包的情况。
ps <- packageStatus()
inst <- ps$inst
View(inst)
image.png
可以发现显示unavailable的都停留在3.4版本没有更新，看起来都是bioconductor里面的包。那么再更新一下bioconductor。结果高于3.5R版本不能用bioconductor了
看了一下bioconductor网站，要这样更新
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install()
windows用户
install.packages("installr")
library(installr)
updateR()
R markdown
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入门R教程
- swirl 包交互课程
使用可参照 https://www.cognize.me/swirl/
