生信星球学习小组第37期Day3——〇

初步学习Linux中的几个常用指令后,今天的主要内容是如何根据自己的需要安装相应的软件。将从软件的来源、安装、配置、使用等几个方面进行介绍。

Linux中的“应用商店”——conda

最方便快捷的软件下载器,没有之一。它的作用就相当于App store,90%以上的软件都能搜到,一键安装。日常生信使用小而精的Miniconda即可。

关于conda、anaconda、miniconda、bioconda的区别

如何下载miniconda

可使用谷歌或百度进行搜索

点击该链接查看相应安装链接

下载

安装miniconda

bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
一路ENTER,yes直到安装成功

安装

  • 添加镜像(不进行这一步使用时会有问题)


    使用清华镜像

使用miniconda(初步)

  • 查看已安装的软件
    conda list
  • 搜索所需软件
    conda search 软件名(=版本号)
  • 安装软件
    conda install 软件名 -y(表示自动安装)
  • 卸载软件
    conda remove 软件名 -y

进阶之conda环境

【今天太累了,后面来填坑:)这好像是第二个坑了呢……==!】

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