非肿瘤生信机器学习+实验验证思路,轻松发表4到5分SCI论文

非肿瘤生信不好发?非肿瘤生信机器学习与实验验证不会结合?这些都不是问题,现在我们手把手分享一下非肿瘤生信机器学习+实验验证的思路,具体分析步骤如下:

分析流程

第一步,差异分析

第二步,GO、KEGG富集分析

第三步,lasso回归分析

第四步,SVM-RFE分析(支持向量机递归特征消除)

第五步,取lasso回归分析与SVM-RFE分析的交集

第六步,对机器学习选出的关键基因绘制箱线图

第七步,对机器学习选出的关键基因绘制ROC曲线

第八步,关键基因与免疫细胞的相关性分析

第九步,实验验证

第一步,差异分析


第二步,GO、KEGG富集分析


第三步,lasso回归分析


第四步,SVM-RFE分析(支持向量机递归特征消除)


第五步,取lasso回归分析与SVM-RFE分析的交集


第六步,对机器学习选出的关键基因绘制箱线图


第七步,对机器学习选出的关键基因绘制ROC曲线



第八步,关键基因与免疫细胞的相关性分析


第九步,实验验证

根据自己的实际条件进行验证,最简单的就是用PCR验证表达量…如果经费比较充足的话,还可以补功能实验,甚至是探索作用机制...

现在纯生信的大势已去,生信+实验已经成为大趋势,这种生信分析+实验验证的思路赶紧学习起来

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