缺失值处理

GSE25618 <- getGEO('GSE25618', destdir = ".",

                AnnotGPL = F,

                getGPL = F)

eSet=GSE25618[[1]]

probes_expr <- exprs(eSet)

#BiocManager::install('impute')

library(impute)

exp <- impute.knn(probes_expr, k = 10, rowmax = 0.5, colmax = 0.8, maxp = 1500, rng.seed=362436069)

exp <- exp$data

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