氨处于发病核心地位，非离子氨能透过血脑屏障到达脑部，离子型氨不易透过屏障，无毒。体内氨的主要来源与肠道，其中：1.谷氨酰胺在肠道上皮代谢出氨；2.肠道细菌能分泌氨。
氨对脑功能的影响：1.干扰三羧酸循环2.增加脑对中性氨基酸的摄取3.星形胶质细胞谷氨酰胺合成增加，内渗透压增加，导致脑水肿。4.直接感染神经电活动。
因为当门脉高压时，门体分流严重，肠道吸收的氨无法很好地被肝脏代谢，且肝硬化时肝对氨的代谢能力也会减退。导致血氨升高。
在肠道ph小于6时，氨以离子形式吸收，问题不大，当ph大于6时，氨以气体分子形式吸收，问题很大。因此要预防碱中毒，不能用碱性的肥皂水灌肠。
神经递质和锰离子也是重要的发病机制。安定会诱发肝性脑病。
肠道摄入过量蛋白，碱中毒，镇静药，肾前性氮质血症，门体分流手术都会成为肝性脑病的诱因。
主要根据腱反射，肌张力，病理反射，扑翼样震颤，脑电图的不同分为5期。0期有心理测试和智力测试的异常。
治疗：1.去除诱因2.营养支持，急性期禁蛋白3.减少肠源性毒物吸收4促进尿苷酸循环5.调节神经递质6.治疗基础病。
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