《学习小组Day3笔记--sy》

linux中安装软件

1.安装miniconda

  • 搜索conda 找到合适版本（一般都是-64）
  • 右键复制链接
  • 打开Ubuntu，cd 安装的文件夹 wget 粘贴网址（右键）
  • 不成功 需要 bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
    bashshell脚本
    按enter 跳过中间信息 直到[yes|no] 输入yes
  • 看到thank you for installing成功
  • 激活 source ~/.bashrc

2.使用miniconda

  • conda list看到conda列表
  • conda search fastqc搜索软件
  • conda install fastqc-指定版本 -y下载fastqc
    -y自动
  • conda remove fastqc -y卸载

3.配置环境

  • conda info --evns*为默认环境
  • conda create -n rna_seq python==3 fastqc trimmomatic -y
    建立一个名叫rna seq的conda环境，然后指定python版本是3，安装软件fastqc、trimmomatic
  • conda info --evns 环境已添加
  • conda activate rna_seq指定默认环境
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