参考文献
[1]陈剑山,郑服丛.ITS序列分析在真菌分类鉴定中的应用[J].安徽农业科学,2007(13):3785-3786+3792.DOI:10.13989/j.cnki.0517-6611.2007.13.011.
[2]林晓民,李振岐,王少先.真菌rDNA的特点及在外生菌根菌鉴定中的应用[J].西北农业学报,2005(02):120-125.
ITS序列
在 rDNA 基因中,5.8S rDNA 和 28S rDNA 基因间隔序列称为ITS序列(内源转录间隔区,Internally Transcribed Spacer),它的长度和序列变化较大,将其扩增物进行 RFLP 或序列分析,可用于对真菌的不同生物型、菌株、种、属进行分类鉴定。甚至用于区分关系非常近的种。
ITS结构
ITS鉴定
是指对ITS序列进行DNA测序,通过将测序得到的ITS序列与已知真菌ITS序列比较,从而获得待测真菌种属信息的一种方法。应用于真菌种属鉴定。
rDNA
核糖体DNA(Ribosomal DNA,rDNA)是一种DNA序列,该序列用于rRNA编码。核糖体是蛋白质和rRNA分子的组合,翻译mRNA分子以产生蛋白质的组件。真核生物的rDNA包括一个单元段,一个操纵子,以及由NTS、ETS、18S、ITS1、5.8S、ITS2和28S束组成的串联重复序列。rDNA的还有另一个基因,由SrRNA基因编码,位于大多数真核生物的基因组中。SrDNA序列也存在于果蝇的串联重复序列。
rDNA内转录间隔区 (ITS) 在外生菌根菌分子鉴定上的作用及应用方法
- 作用
ITS1和ITS2是中度保守区域, 其保守性基本上表现为种内相对一致, 种间差异比较明显。这种特点使ITS非常适合于真菌物种的分子鉴定以及属内物种间或种内差异较明显的菌群间的系统发育关系分析。在外生菌根菌的分子鉴定方面, ITS区段的应用尤为普遍。 - 方法
1.以ITS区段的长度 (分子量) 作为标记特征进行分子鉴定
2.以ITS区段的RFLP图谱作为标记特征进行分子鉴定
3.用特异性引物扩增ITS区段, 从而达到鉴定的目的
4.设计专一性探针进行分子杂交的鉴定方法
5.根据DNA序列进行分子鉴定