circRNA与lncRNA一样,可以结合蛋白,通过改变结合蛋白的功能,影响结合蛋白下游的靶标(结合蛋白的结合分子)。结合对象是蛋白,其功能显著,对表型影响较大,可以做出比较好的机制。目前circRNA结合蛋白的机制研究仅次于ceRNA。其调控机制非常灵活,因为也是高分文章常见的思路。
那么我们做RNAseq找到了circRNA,想做结合蛋白机制研究,如何寻找结合蛋白,结合蛋白确定后,又该如何确定下游的靶标分子,怎么跟表型关联呢,如何关联到信号通路上?本期我们就来讨论一下这些问题。
主要讨论内容:
(1)circRNA结合蛋白后如何调控靶标蛋白 ?
(2)circRNA结合蛋白如何跟靶标关联 ?
(3)circRNA都是如何关联到通路的 ?
以下是视频录屏链接,有需要的老师可以观看。