内容

前言

。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 v

贡献者

。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 ix

1单细胞RNA-seq的质量控制。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 1
彭江
2单细胞RNA-Seq数据分析的标准化。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 11
朗达·巴彻（Rhonda Bacher）
3单细胞RNA测序技术和生物变异性分析。 。 。 。 。 。 。 。 。 。25
金朴石，李恩敏和金钟京
4从单细胞转录组学数据鉴定细胞类型。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 45
Karthik Shekhar和Vilas Menon
5稀有细胞类型检测。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。79
蓝江
6 scMCA：一种基于单细胞数字表达定义鼠细胞类型的工具。 。 。 91
孙慧宇，周寅聪，费丽江，陈海德和郭国冀
7差异通路分析。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 97
范让
8使用TSCAN的伪时间重建。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 115
纪志成和纪洪凯
9使用单细胞熵（SCENT）估计单细胞的分化潜能。 。 。 。 。 125
Chen Weiyan Chen和Andrew E. Teschendorff
10 从单细胞RNA测序数据推断基因共表达网络。 。 。 。 。 。 。 141
艾丽西亚·拉米尔（Alicia T.Lamere）和李俊
11单细胞等位基因特异性表达分析。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 155
董美晨和江玉超
12使用BRIE检测和分析scRNA-Seq数据中剪接异构体。 。 。 。 。175
黄元华和吉多·桑吉内蒂
13单细胞表观基因组数据集预处理与计算分析。 。 。 。 。 。 。 187
卡莱布·拉罗（Careb Lareau），Divy Kangeyan和Martin J.Aryee
14 单细胞增强剂摄动分析实验和计算方法
。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 203
谢诗琪和韩志勋
15来自scRNA-Seq数据的抗原受体序列的重建和克隆推论。 。 。 223
艾达·林德曼（Ida Lindeman）和迈克尔·T·史都本顿
16一个用于检测空间转录数据域组织的隐马尔可夫随机模型。 。 251
千竹
索引。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 。 269