今天在使用RseQC时需要将参考基因组GTF文件转换为bed12文件，下面是记录下来的方法：
用到的工具
UCSC的gtfToGenePred和genePredToBed工具，下载安装：
wget -c http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/gtfToGenePredwget -c http://hgdownload.cse.ucsc.edu/admin/exe/linux.x86_64/genePredToBedchmod u+x gtfToGenePred genePredToBed
方法
gtfToGenePred genes.gtf genes.genePredgenePredToBed genes.genePred genes.bed
结束，撒花~
作者：Bio_Infor
链接：https://www.jianshu.com/p/de2455a8f507
来源：简书
著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。
