荧光定量PCR

1、扩增曲线(如果做双ΔCT法):
(1)扩增曲线必须是S型,有明显的四个时期,且复孔的CT值尽量一致bai,相差不要超过0.5个CT值(上限是1个CT值);
(2)同一个基因在不同浓度的相同模板下扩增,其相差的CT值为相差浓度倍数的2次开方。当然这是理论值;另外阴性对照不能有扩增(40个循环以后出CT值属正常现象,也可算作没有扩增)。

2、溶解曲线:
(1)溶解曲线是判断扩增产物是否单一的曲线,顾名思义,其跟模板(或其浓度)没有关系,扩增什么基因就应该有其相对应的溶解曲线;
(2)一般SYBR法的目的基因峰值在80~90℃之间;
(3)出现其他峰就该考虑是否为引物二聚体(一般为60~75℃之间)视引物长度而定,而基因组DNA污染的峰会在90℃以后。出现引物二聚体可能是引物设计、引物加量等原因所致;
(4)基因组DNA那么考虑设计跨内含子引物或者实验之前做gDNA的消除工作。而阴性对照有目的峰那可能就是模板污染,注意实验操作等避免模板污染。

3、溶解曲线是为了验证扩增产物特异性的,要是溶解曲线是单峰说明产物只有一条,结果较好;要是双峰说明产物不特异,可能存在引物二聚体或非特异性扩增,有可能引物设计有问题。

溶解曲线分析:

1、可以用来确定不同的反应产物,包括非特异性产物。
2、扩增反应完成后,通过逐渐增加温度同时监测每一步的荧光信号来产生溶解曲线,随着反应中双链DNA变性,荧光染料又回复到游离状态导致荧光信号降低。
3、用荧光信号改变的负的一次导数与温度作图,在扩增产物的溶解温度上有一特征峰(Tm,DNA双链解链50%的温度),用这个特征峰就可以将特异产物与其它产物如引物二聚体区分开,
4、溶解曲线是为了观察扩增发出荧光的片段是不是需要的产物。如果溶解曲线做出来只有单峰,且出锋位置是退火温度,那么这个是产物发出的荧光,实验结果有效。
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