如何使用EasyDL训练影像组学模型

之前接触EasyDL-零门槛AI开发平台 (baidu.com),是因为它提供了一些无需代码的深度学习应用接口。然而这些接口大多应用于图像上,用了一段时间之后就放弃了。最近随意浏览网页,发现EasyDL提供了表格数据的建模分析,非常好奇,就尝试了一下。

目前这个还是面向工业化的使用,对科研并不是特别友好。如果您做科研,下面的内容看了也不会对您有价值,不看也不会对您有损失。慎看。

1 选择表格数据预测接口

进入EasyDL界面,如下图所示,点击立即使用

easyDL_1.png

出现如下的界面,选择表格数据预测

easyDL_2.png

2 上传影像组学数据

上一步打开之后,在新的界面最左侧边栏里面选择数据总览

easyDL_3.png

点击创建数据集

easyDL_4.png

根据内容进行填写,主要是给数据集一个名称,这里我们叫做demo2,点击完成
easyDL_5.png

在新的界面,可以看到我们的数据集,然后点击红色箭头所指的导入
easyDL_6.png

在新的页面下,导入方式选择上传csv文件,然后点击上传。这里需要注意,建议把Label列放置在最后一列。不然在后续的模型训练中会报错, 另外数据不能超过1000列。上传完成后,点击确认并返回。数据上传完毕,这里也是建议只上传训练的数据集。
easyDL_7.png

3 模型训练

数据上传完成后,可以进行模型训练,从下面的界面中,选择创建模型

easyDL_3.png

在弹出的窗口,输入相关信息。
easyDL_8.png

创建完成后,可以看到我们创建的模型,这时点击训练
easyDL_9.png

在新的窗口,选择数据集,选择目标列,指定二分类,然后点击开始训练

easyDL_10.png

训练完成后,我们能够获取模型的一些效能参数,可以从我的模型进去,选择完整评估结果,会的看到如下所示的结果图:

easyDL_12.png

easyDL_14.png

easyDL_13.png

4 模型部署

很遗憾,虽然EasyDL提供了校验模型的功能,但是不能用来大批量的对验证的数据集进行验证。因此需要先对模型进行部署,才能访问。如下所示,选择模型,选择发布,即可。


easyDL_15.png

5 如何调用模型

本人比较熟悉R语言,介绍一下如何从R中调用模型,并进行验证:

5.1 获取访问模型的参数
  1. 接口地址: 从我的模型, 找到服务详情,点击在弹出的窗口找到接口地址

    easyDL_17.png

    easyDL_18.png

  2. access_token: 从百度智能云,控制台创建应用。创建完成后,会得到一个API KeySecret Key,通过这两个Key,可以获取部署模型的访问access_token

    easyDL_16.png

采用如下的命令,用自己模型的API KeySecret Key来替换下面的[]content(r)命令,会显示access_token

library(httr)
r <- GET("https://aip.baidubce.com/oauth/2.0/token?grant_type=client_credentials&client_id=[API Key]&client_secret=[Secret Key]")

content(r)
5.2 模型验证

采用如下的命令导入数据,并获取结果:

library(tidyverse)
library(jsonlite)
dt.test<- read_csv('test.csv')
dt.test<-dt.test[, -ncol(dt.test)] # 把最后一列Label删除,只保留特征

res<- POST(url = 'https://aip.baidubce.com/rpc/2.0/ai_custom/v1/table_infer/radiomics_test?access_token=[access_token]',
     body = toJSON(list(include_req = F,  data = dt.test[1, ])), 
     encode = 'raw')

content(res)$batch_result[[1]]$Label #显示预测的Label

小结

整个流程在训练和部署阶段相对简单,但是后续的的验证还是需要代码的介入,好在很多语言都提供了web api访问的接口。

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