消化性溃疡的发病机制是胃酸、胃蛋白酶侵袭作用与黏膜保护作用之间的失衡，上腹痛是其主要症状，包括胀痛、烧心、反酸等现象，空腹疼痛多为十二指肠溃疡、餐后疼痛多为胃溃疡，平胃散作为湿滞脾胃的基础方，常用于急慢性胃肠炎和消化性溃疡。
平胃散方解中有这样一段表述：湿邪滞于中焦，则脾运不健，且气机受阻，故见脘腹胀满；胃失和降，上逆而为恶心呕吐、嗳气吞酸。胀满、恶心、吞酸等描述与胀痛、烧心、反酸一致，可以明显看出中医所说的湿邪困阻之象与现代医学所说的消化性溃疡症状相符。
平胃散方中苍术为君药，对胃肠运动机能有双向调节作用、能抑制溃疡患者的胃液量和酸度，与中医运脾和燥湿含义吻合；方中臣药厚朴可辅助君药抑制黏膜溃疡、且可以兴奋肠管平滑肌，与中医所说化湿和行气十分吻合；佐药陈皮能抑制胃溃疡和胃酸、兼有调节胃肠运动的效果，这与中医所说的理气、燥湿、和胃基本一致；使药甘草同样具有抑制胃酸分泌、促进溃疡愈合的作用，还能拮抗肠管痉挛，与和中、健脾、益气说法基本吻合。
从以上中西医对药效的描述来看，益气、行气、运脾、健脾与胃肠运动机能相关，而化湿、燥湿与溃疡愈合有关，和中、和胃则与调节胃酸分泌相关。
通过对平胃散中西医对比分析，可以明显看到，传统中医所说的燥湿与行气，与消化性溃疡和胃肠运动机能关系密切，正如平胃散方解中所说：燥湿以健脾、行气以祛湿。湿，具有黏膜溃疡的一种体征意象。
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