HDOCK分子对接

HDOCK是用来做蛋白和蛋白或分子之间对接的软件,文章链接为:
https://doi.org/10.1038/s41596-020-0312-x

1.安装

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http://huanglab.phys.hust.edu.cn/software/hdocklite/

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#解压 
tar -xzvf HDOCKlite.tar.gz && cd HDOCKlite-v1.1

2.使用

#输入两个pdb文件,即可对接,有一些参数-h查看 
./hdock ../pdb/1.pdb ../pdb/2.pdb 
#结果输出为Hdock.out,再生成pdb即可 
./createpl Hdock.out output.pdb
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