包裹着生豆的内果皮是很好的保护层，但带着内果皮一起运送会增加重量和成本，因此必须在运送之前脱壳以节省运输开销。
脱壳就是在干处理厂（dry mill）使用脱壳机去除内果皮，主要有两种机型：摩擦脱壳机和紧压脱壳机。采用摩擦脱壳机的国家主要是巴西，恩格尔贝格（Engelberg）和斯莫特（Smout）是比较常见的两种机型。紧压脱壳机包括滚动式和横杆式两种机型。
脱壳时生豆必须有适度的含水量，否则就有可能破裂。脱壳之后通常会有一些银色外皮残留在生豆上，须通过抛光予以去除。用紧压脱壳机脱壳的生豆外观上总是比用摩擦脱壳机脱壳的生豆显得杂乱，通常需要抛光，抛光后会给人一种档次高的主观感受。
脱壳处理的重点是去除有瑕疵的生豆。干处理厂一般都会有筛选或分级设备：脱壳之后的生豆会被输送到色选机去检测颜色，任何有明显瑕疵的生豆都会被挑除；再被输送到大型多层震动式筛网去检测尺寻，将不同尺寸的生豆分类；最后还要进行手工挑选。
手工挑除有瑕疵的生豆十分费时，通常由女性工作者在输送带的配合下进行。她们要在各自分派到的生豆中尽可能地挑除掉所有存在瑕疵的生豆，工作单调乏味但报酬也差强人意。这个工序的确增加了生豆干处理的成本，但同时也大幅度地提升了生豆的品质。
参考文献：《世界咖啡地图》/（英）詹姆斯·霍夫曼著，王琪、谢博戎、黄俊豪译/中信出版社2016年6月版。
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