Linux系统是进行生物信息学分析的基石，许多生物信息学软件都是基于Linux系统开发的。所以学习Linux对于生物信息学分析尤为重要。
学习链接：https://research.biomart.cn/experiment/course_detail.htm?id=25&from=wechat_20190713
Linux系统具有很多优势：
去可视化：使用命令行模式、节省计算资源
文件和目录结构管理
安全、稳定、多线程
权限设置
适合处理大文本
等等等
Linux命令入门
通用的终端命令格式是
命令+参数+文件（必须空格分隔）
command options arguments
为了更好的进行linux学习，
Windows用户可以下载git软件，可以进行去可视化操作
Mac用户可以寻找终端，进行去可视化操作
当然，最好可以在服务器上进行学习和操作
具体的服务器介绍，可以参考一下生信技能树的内容：http://www.biotrainee.com/thread-108-1-1.html 里面有各种云服务器和实体服务器的使用方法的介绍
下面开始今天的Linux学习笔记：
Linux基本命令---目录集
首先要学习Linux系统的目录结构
/ #根目录，是系统最起始的目录，所有的文件都在根目录下面
/bin #可执行二进制文件的目录 如 ls 等命令
/home #家目录，系统默认的用户家目录
/etc #系统配置文件存放的目录，一般刚开始接触linux的同学暂时不要去鼓捣
/root #存放启动linux时使用的一些核心文件
了解了Linux系统的目录结构，接下来学习目录常用命令
ls #显示目录内容列表
mkdir #创建目录 mkdir -p 可以进行递归创建
rmdir #删除空的目录
cd #切换到某一个目录下
cp #将文件复制到目标目录下
mv #移动目录、文件或者重命名目录、文件
pwd #绝对路径方式显示用户当前工作目录
find #查找文件
dirs #显示目录记录
touch #生成一个空文件或者更改文件的时间
ln #建立软链接
echo #把内容重定向到指定的文件中
Linux基本命令---文件命令集
文件操作命令
cat #查看文件内容并且打印到屏幕上
head #查看文件前几行
tail #查看文件后几行
less #查看文件，可以上写翻页浏览内容
more #显示文件内容，每次显示一屏幕
touch #创建我呢见
find #查找文件和文件夹
diff #查看两个文件是否有差异
rename #重命名
mv #移动和重命名
wc #统计文件中的字节数
路径的表示方法
路径有两种表示方法：绝对路径和相对路径
绝对路径： 从根目录“/”开始，并且使用“/”将各级目录分隔开
相对路径：目标目录相对于当前目录的位置
. 代表当前目录
.. 代表上一级目录
- 代表前一个目录
~ 代表家目录（用户的个人主目录）
在进行文件批量操作过程中和文件查找过程中，通配符具有重要的作用
通配符的规则
##通配符用来匹配符合条件的文件名，通配符是完全匹配
符号 含义 举例
* 代表任意（0到多个字符） ls *fastq #查找以fastq结尾的所有文件
ls test* #查找以test开头的所有文件
？ 代表文件中任意一个字符 ls test?.sh #查找test开头的 .sh结尾的文件
[] 查找[]范围内的任意一个字符 [abc]匹配abc中的任意一个
[a-c] 匹配a-c中的任意一个
{} 命令区块组合或者内容序列 mkdie 2016_{a..z} #创建文件夹2016_a,2016_b......2016_z
