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ls（查看）命令展示文件
一、相对路径访问
ls -a 可以看到隐藏的文件
ls -l 就可以看到详细的列表信息（数列）
蓝色是文件夹，红色是压缩包
时间表示最后一次修改的时间，数字表示文件大小
ls -l -h 文件大小会简洁：以易于阅读的形式，列出文件大小，如K/M/G
ls -lh rnaseq-apple-training(文件名称）显示文件夹里的文件
ls -lh rnaseq-apple-training/linux-basic/ rnaseq-apple-training下的linux文件
tab键可自动补全文件名称
ctrl+L清空画面
二、绝对路径访问
ls -l /访问根目录
特殊目录：ls -l ~ 表示家目录（home下的用户名）
cd 文件名 直接跳转目录（change directory）;如不写参数及文件名则回到用户的home目录
如果不知道文件夹里有什么文件不能直接访问，则cd 文件夹名，按两下tab键，即可显示文件夹下的文件
返回上级目录的方式：1、绝对路径 cd 一长串目录
2、相对路径 cd . 代表当前目录；cd .. 代表上级目录；cd ../.. 代表上上级目录
3、cd ~ 去home目录
查看文件内容
cat 文件名字（可以是相对路径也可以是绝对路径）
如果命令一直运行，按Ctrl C终止命令
空格键翻页，回车键换行，q键退出
大文件不要用cat命令，用less 命令
在less命令中退出按Q，当要在less命令下找想要查看的内容时，在左下角输入/基因名称
less -N 文件名 可以添加行号
若字体太大，行号错乱时，less -N -S 文件名 使字体变小，保证一行的内容就在一行上
head 文件名 只查看文章大概有什么（前几行）
tail 文件名 只查看文章后几行
head -n 3 文件名 看前三行
将前十行放到另一个文件里
wc 文件名 查看建好的文件有多少行（第一个数字）
wc -c 文件路径 统计bytes数量
wc -m 文件路径 统计字符数量
wc -l 文件路径 统计行数
wc -w 文件路径 统计单词数量
tail -n 路径 查看尾部多少行 不写-n默认十行
tail -n 10 文件名 ＞ head10.fasta 一个大于号是覆盖之前的内容（重定向符）
tail -n 10 文件名 ＞＞ head10.fasta 两个大于号是追加在之前的内容后面
提取某个文件的400到500行
意思是将这个文件中的前500行提取出来，然后再从这五百行里提取后101行，到一个文件里
grep "某种特征” 文件名 将文件中包含某种特征的行筛选出来
两种看有多少行的方法
ls -l *.fasta 将文件夹中含有fasta的文件挑选出来
grep "某种特征” 文件名 | sort | unic | wc 排序并去除重复
编辑文件内容
vi 文件路径
vim 文件路径
:w 保存 :q 退出 :wq保存并退出
命令模式快捷键
创建文件夹（mkdir [-p] linux路径）
涉及到权限问题，创建时在home及home下的文件夹中创建
创建文件（touch 路径）
复制文件或文件夹（cp）
移动文件或文件夹（mv,没有选项）
删除文件或文件夹（rm）
rm 文件名 可以删除这个文件
查找命令和文件（which/find）
过滤（选出）包含关键词的行（grep）
过滤时关键词最好都带双引号
管道符：| 将左边命令的结果作为右边命令的输入（也可以嵌套使用）
超级管理员（切换）
普通用户不能在根目录下执行一些操作，只能在home路径中操作
进入或退出root(回退可以用exit命令，也可以用ctrl+d快捷键)
暂时以root身份执行（sudo,但需认证）
用户与用户组管理（root用户执行）
1、创建用户组：groupadd 用户组名
删除用户组：groupdel 用户组名
2、用户管理
3、查看系统中的用户：getent passwd
结果共有七份信息：
4、查看系统中的用户组：getent group
共有3份信息
