明正德十一年，兵部尚书王琼推荐王阳明任都察院左佥都御史，巡抚南安、赣州、汀州、漳州等处，主要任务是负责平定当地以少数民族为主的土人叛乱。
王阳明一上任，首先是推广“十家牌法”。要求每户人家在门口悬挂一块木牌，上面写清楚本户姓名、人口数目、籍贯、有没有暂住人员等基本情况；每十家为一个基本单位，也有一块木牌，上面写清楚十户人家的户主姓名、家庭人口、籍贯等等。从而切断山上贼寇与山下的信息交通，确保军事行动的机密性和有效性。
王阳明可谓是中国“团练”的始祖，“民兵”的创始人。清代曾国藩大办团练培养湘兵，就是从王阳明处学来的。当年，王阳明培育民兵，其实是出于无奈。之前，赣粤闽湘四省边际地区闹匪乱，朝廷派来的军队多是湘西或贵州、广西少数民族地区的狼兵，这些狼兵多属于当地土司豢养的家兵，他们以当兵为业，凶猛勇敢，吃苦耐劳，善于爬山钻林，南赣的山贼十分惧怕他们。于是，南赣的山贼们采取回避的战术，狼兵来了，他们躲藏起来，狼兵回去了，他们又出来骚乱。而狼兵除了赣州卫所留下来世袭外，其余各地请来的狼兵是要回去老家的，一来一回得一年，又费钱财又没用。囿于这种情况，王阳明决定培养当地民兵。他让各州府从所属县衙的弩手、捕快、打手中各挑选骁勇者十名左右为将官，又从各卫所中挑选有实战经验者充当教官，让他们编练民兵。很快，一支比朝廷卫所官兵更有战斗力的民兵队伍组织了起来，为王阳明之后的平定民乱奠定了坚定的战斗基础。
战前准备工作都安排妥当后，王阳明下令先集中兵力围剿闽西漳州一带的山寇。仅用时三个月，漳州十余年不息的叛乱就被平定了。
接着，王阳明向赣南地区进发。这次他改变战术，四处张贴告谕文，规劝山寇投诚，让参与叛乱的百姓和少数民族有改过自新的机会。结果，赣南百余年的积患，也在一年之内都平定完毕。
随后，王阳明又在各地区交接处设立县治，在关隘的地方设立巡检司，同时恢复乡约制度，让德行好的老人负责教化当地百姓，还建立社学，通过教育来保障当地的长治久安。
