丹麦开始新的课题，导师要求一切课题进展都展示在GitHub上，方便其他人协作完成课题项目。对于我来说算是真正开始接触使用github。
GitHub简介
github是目前世界上最大的代码存放网站和开源社区。我们可以利用github创建自己的代码仓库，同时访问追踪其他人的代码仓库，还可以多人协同完成工作项目。
使用方法总结
github有很多作用，对于常见的作用：
- 存放代码，更新仓库；
## 上传本地仓库
git add filename
git commit -m 'update'
git push
#**************
## 若远程仓库有改动,需要先git pull, git add . 点表示加入所有变化，也可以指定具体的filename, 可以多次git add，一次git commit
git pull
git add .
git commit -m 'update'
git push
具体使用教程
1. 下载安装git,R,Rstudio,并注册github账号
这些准备工作很简单，这里不做介绍。
2. 创建github资源库（repository）
打开https://github.com/new
输入资源库的名字（库的名字与本地的dir_name可以不同），添加描述（可选择），设置是公开还是私秘的（私密的需要付费），勾选创建readme文件（这里最好勾选，如果是空目录的话，本地同步github会出现错误），创建。
图1 创建github资源库
3.通过Rstudio关联本地文件和github
-
Rstudio的配置
首先打开File,创建New Project, 如果路径下没有创建就选择New diresctory,如果已经有目标路径，就选择Existing Directory；
image.png
然后打开Tools，Globe Options，Git/SVN, 选择git安装路径，同时点击View public key, 复制；
然后打开github settings的 keys, 创建New SSH key, 将复制的key粘贴进去。
图3
4.本地文件夹与github关联
打开Tools的shell窗口，首先设置用户名和邮箱
git config --global user.email "renyunxiao16@big.ac.cn" ##设置邮箱
git config --global user.name "yunxiao" ##设置用户名
添加本地文件或文件夹
# 初始化
git init
# 添加远程 Git 仓库，空白仓库需要origin, 后面是仓库的http或git地址
git remote add origin https://github.com/lassefolkersen/ren-folkersen-deconvolution.git
# 提交
git commit -m 'first commit'
git push origin master
若是已知仓库，添加更新文件
## 如果远程仓库有变化，先将远程文件拉下来，用git pull
git pull
git add .
## git add specific_file, .是所有文件，多次添加的文件可以一次提交
git commit -a -m "update"
## update 注释变动的原因和内容
git push origin master
## git push 将文件提交远端仓库
常见错误及解决办法
- `git remote add origin https://github.com/lassefolkersen/ren-folkersen-deconvolution.git'
fatal: not a git repository (or any of the parent directories): .git
git init - Note about fast-forwards
git push origin master
To https://github.com/lassefolkersen/ren-folkersen-deconvolution.git
! [rejected] master -> master (fetch first)
error: failed to push some refs to 'https://github.com/lassefolkersen/ren-folkersen-deconvolution.git'
hint: Updates were rejected because the remote contains work that you do
hint: not have locally. This is usually caused by another repository pushing
hint: to the same ref. You may want to first integrate the remote changes
hint: (e.g., 'git pull ...') before pushing again.
hint: See the 'Note about fast-forwards' in 'git push --help' for details.
git pull origin master
git push -u origin master -f
其他常见操作
删除仓库或文件夹
删除仓库从settings下删除,删除文件从命令行即可
git remote rm test
恢复历史版本
#查询显示
git reflog
10e2ff3 (HEAD -> master, origin/master) HEAD@{0}: reset: moving to 10e2
10e2ff3 (HEAD -> master, origin/master) HEAD@{1}: commit (initial): add folder
#恢复
$ git reset --hard 10e2
HEAD is now at 10e2ff3 add folder
