scRNA---Day8(scater)

续昨

可视化：

按示例数据选取前6个基因，一般实验中选取marker基因：

6geneplot.png

6plot.png

降维

1. runPCA()

2. t-distributed stochastic neighbour embedding (t-SNE)

   
   
   multiplot.png

PCAplot.png

plateplot.png

Trf-gplot.png

Trfplot.png

Trf-sizeplot.png

tsneplot.png

tsne-Trfplot.png

数据图不好看，主要是为了理解流程走代码