运行STAR比对的时候一直报错
star.sh: line 1: 95538 Segmentation fault (core dumped) STAR --runThreadN 5 --genomeDir /nas01/jiarongf/Homo_sapiens/data/GSE150137/ERV_STAR/STAR_index/ --readFilesIn ../HGPS_Fibroblast_1_fastp.fq.gz ../HGPS_Fibroblast_2_fastp.fq.gz ../HGPS_Fibroblast_3_fastp.fq.gz ../HGPS_Fibroblast_4_fastp.fq.gz ../HGPS_Fibroblast_5_fastp.fq.gz ../HGPS_Fibroblast_6_fastp.fq.gz ../WT_Fibroblast_1.fastq.gz ../WT_Fibroblast_2.fastq.gz ../WT_Fibroblast_3.fastq.gz --sjdbGTFfile /nas01/Genome/fasta_gtf/Homo_sapiens.GRCh38.84.gtf --sjdbOverhang 50 --outFileNamePrefix STAR_150137 --outSAMtype BAM SortedByCoordinate --readFilesCommand gunzip -c --outFilterType BySJout --winAnchorMultimapNmax 100 --outFilterMultimapNmax 100 --outFilterMismatchNoverLmax 0.04 --outTmpDir /nas01/jiarongf/Homo_sapiens/data/GSE150137/ERV_STAR/STARtmp/
是因为同时跑了多个fq文件，STAR每次只能跑一个fq，如果是单端就是in一个fq文件，如果是双端就是同一个fq的1和2。同时跑多个文件的时候可以循环跑
