由于基因分析的需要,有时需要下载一个基因外显子序列,可实现的方式如下:
1 打开NCBI主页,下拉菜单,选择gene选项
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2 输入基因名称,以SDC2为例,点击搜索
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3 选择所要下载的物种及基因,点击基因名称;将鼠标停留在所要寻找的mRNA上(NM开头的序列代表不同的mRNA),出现如下界面,在Download FASTA选项中点击NM_002998.4 exons
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4 下载fasta格式文件
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5 文件内容如下
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同时也可以将剪切体名称NM_002998.4 输入到
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/splign/splign.cgi?textpage=online&level=form
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比对结果如下:
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