2021-11-26 如何下载一个基因的外显子序列

由于基因分析的需要,有时需要下载一个基因外显子序列,可实现的方式如下:
1 打开NCBI主页,下拉菜单,选择gene选项


image.png

2 输入基因名称,以SDC2为例,点击搜索


image.png

3 选择所要下载的物种及基因,点击基因名称;将鼠标停留在所要寻找的mRNA上(NM开头的序列代表不同的mRNA),出现如下界面,在Download FASTA选项中点击NM_002998.4 exons
image.png

4 下载fasta格式文件

image.png

5 文件内容如下

image.png

同时也可以将剪切体名称NM_002998.4 输入到
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/splign/splign.cgi?textpage=online&level=form

image.png

比对结果如下:
image.png

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容