转录组分析概述

我们都只是进化的工具而已,大自然借用我们的身体表达了她的想法。

中心法则

要说转录组就离不开中心法则,那么中心法则讲了一个怎样的故事呢?它其实有点宿命论的感觉,就是我们的一生大部分物理条件都被编码好了,放在我们的身体里。它指导着我们的躯体从一个受精卵成长为一个能够协同一百多万细胞的个体。

DNA只有四个碱基,排列组合出地球上繁花似锦的生物圈。而令人惊奇的是,每个物种的基因组是差不多的,但是个体之间的差异却大的惊人。同一个个体基因组是一样的,但是不同的器官却行驶着完全不同的功能。这就是基因的选择性表达。那么,一套基因组是如何协同和组织十几万细胞的呢?这就离不开转录组的协助了。

基因组是一本书,他的名字也许叫《解忧杂货店》——每个有烦恼的人,都能在他那里得到想要的答案。是的,转录组是基因组的某种映射。同样一段文字,不同的人读来有不同的意味,在转录组这叫做可变剪切。转录组那样的灵活,离不开大量的非编码的RNA。哦,对了,人们管基因叫做DNA,转录的叫做RNA。

DNA并不是一下子就主动地,拿个箭头就指向RNA的,中间要经过来自内外的各种传递信息的信鸽。这些信鸽往往是单线联系的,所以有时候有坏人冒充进来传递了虚假信号,DNA可能会识别不出来。

人们知道NDA的结构没多久,就开始它是如何行驶功能的。其实现在关于转录组的研究已经常态化了,就像化学实验室里要有分光光度计一样。

要研究某一表型的转录本,就要把它拿出来,看看它有多少个,每一个有什么特点。

NGS转录组分析就是这么一个思路:目标区域捕获,建库测序得到碱基序列,这些序列都是ATCG的排列组合有什么意义呢?就要和数据库比对,因为目前测序较短,一般需要组装。比对完了,转录组定量和结构信息就在了。下面的就是用转录组这个大手,去揭开自己要研究的生物学问题的红盖头了。

祝幸福。

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