<<写在前面>>
Conda is an open-source package management system and environment management system.
通俗讲，conda是一个用来管理包和环境的管理系统。这里的“管理”包括：创建环境、切换环境、删除环境等、安装包、卸载包、更新包等。
使用场景1：当某个软件的安装过程需要root权限，而你又没有管理员权限时，就可以优先考虑使用conda install安装。
使用场景2：当某个项目所需的某个软件只支持在指定的python3.X版本下才能安装，而你目前没有这个版本的python，又不想卸载原有的python版本去重新安装一遍python3.X，此时就可以使用conda先创建一个包含python3.X的虚拟环境，然后在指定的环境下安装所需要的软件。
注意：当使用conda install无法进行安装时，可以使用pip进行安装。pip只能安装到当前环境，如果要安装到其他环境，要先切换到目标环境。
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1.从官网下载Anaconda的安装包
https://repo.anaconda.com/archive/
注意：有不同系统(mac, linux, windows) 和不同版本可选，推荐选择当前最新版本。
$ mkdir -p /dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/
$ cd /dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/
$ wget https://repo.anaconda.com/archive/Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh
2. 验证下载的完整性
$ sha256sum Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh
a7c0afe862f6ea19a596801fc138bde0463abcbce1b753e8d5c474b506a2db2d
注意：将得到的哈希值与官网提供的哈希值进行对比(https://docs.continuum.io/anaconda/install/hashes/all/)，如果一致，说明下载到的shell文件是完整的。
3.安装Anaconda
$ sh Anaconda3-2022.05-Linux-x86_64.sh
持续按回车键，
中途需要停顿2次，
一次需要输入“yes”，
一次需要输入安装路径"/dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/anaconda3/"
直到出现“Thank you for installing Anaconda3!”字样，代表安装成功。
4.初始化Anaconda
$ source /dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/anaconda3/bin/activate
$ conda init
5.验证conda安装成功
以下方法三选一
$ conda -V
$ conda -h
$ conda list
conda 4.12.0
6.使用conda管理环境
6.1 查看所有环境列表
带有星号*的代表当前所处的环境
$ conda info --envs
# conda environments:
#
base * /dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/anaconda3
6.2 创建一个新环境
例1. 创建一个名为“snowflakes”的新环境
$ conda create --name snowflakes
例2. 创建一个名为“snakes”的新环境，其中包含 Python 3.9
$ conda create --name snakes python=3.9
例3. 创建python=3.7版本的环境，取名叫py37
$ conda create -n py37 python=3.7
6.3 激活/进入新环境
$ conda activate (环境名)
例1：$ conda activate snowflakes
例2：$ conda activate snakes
例3：$ conda activate py37
(py37) 行前括号内容改变为目标环境名就是成功了。
6.4 退出环境
$ conda deactivate
6.5 删除环境
$ conda remove -n py37 --all
6.6 验证当前环境中的 Python 版本
$ python --version
Python 3.9.12
6.7 停用当前环境并返回base环境
$ conda activate
7.使用conda管理包
7.1 安装包
安装到当前环境
$ conda install (包名)
例1：$ conda install tk
例2：$ conda install -c bioconda segemehl
安装到指定环境
$ conda install --name (环境名) (包名)
例：$ conda install --name py37 tk
7.2 验证包是否安装成功
$ conda list segemehl
# packages in environment at /dellfsqd2/ST_LBI/USER/myname/app/conda/anaconda3:
#
# Name Version Build Channel
segemehl 0.2.0 0 bioconda
7.3 卸载包
卸载当前环境中的指定包
$ conda remove (包名)
卸载指定环境中的指定包
$ conda remove --name (环境名) (包名)
7.4 更新指定包
$ conda upgrade (包名)
或
$ conda update (包名)
8. Conda版本升级
当有更新版本的conda可用时，屏幕会打印出如下提示语:
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.12.0
latest version: 22.9.0
Please update conda by running
$ conda update -n base -c defaults conda
$ conda update -n base -c defaults conda
$ conda -V
# conda 22.9.0
欲知更多：
https://conda.io/projects/conda/en/latest/user-guide/getting-started.html
