gromacs续跑

跑模拟总要遇到续跑的问题,因为经常会由于网络或服务器的原因导致模拟中断。gromacs中续跑的指令是 mdrun -s *.tpr -cpi

有时也会因为初始设定的模拟时间不够长,想延长模拟时间。这时候用到的指令是tpbconv,以改变.tpr里设定的模拟时间。再用mdrun -s *.tpr -cpi续跑。

这里提供一个新的思路。先在初始的.mdp文件里更改模拟时间nsteps,用grompp重新生成.tpr文件,再用新生成的.tpr文件mdrun -s *.tpr -cpi续跑。亲测有效。

©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容