分子生物学方法通过对样品基因测序，为获取序列信息提供了一种快速的方法。随着全基因组测序的发展，我们离获知所有基因（也可以说是所有蛋白质）序列信息的距离越来越近。然而，仅仅对基因序列的了解，并不能为我们提供蛋白质功能相关的重要信息，如分子间和分子内二硫化物键合模式、修饰或其他处理方式。蛋白质序列测定则能实现这一目的，并且可以鉴定与特定发展阶段或疾病发生相关的蛋白质。
蛋白质序列测定的最初目的即是为了确定蛋白质的全部或部分序列，以便更好地了解其结构和功能。此方法中，结合其他特性（如蛋白质分子量、PI或数量），仅需几个残基的短序列就可用已知基因序列数据库进行筛选。蛋白质序列测定在保证“生物制药”（分子生物学革命的产物）重组治疗性蛋白质的品质上也扮演着重要角色。
Edman测序反应过程（图片来源：百泰派克）
艾德曼降解法测序（Edman降解法测序）是蛋白质测序常用的方法之一。随着各种质谱方法的不断补充和完善，Edman降解法可用于鉴定蛋白质及其衍生物，根据目标肽到单个氨基酸残基的片段化模式确定肽的序列。Edman降解蛋白质测序法有多种用途：（以下引自百泰派克生物）
（1）验证蛋白表达产物：重组蛋白插入位点和表达顺序是否正确
（2）验证细胞株建立和发酵过程中蛋白产物：验证细胞株建立和发酵过程中蛋白产物N端甲硫氨酸和信号肽是否正确处理；
（3）分析蛋白降解/酶切：对降解/酶切形成的新蛋白片段N端进行分析，确定断裂/酶切位点；
（4）De-novo测序：对于蛋白数据库中不存在的全新蛋白序列进行分析。
作者：西西里的传说
来源：LOFTER
