送给lxh小姐姐

每日任务

一、linux的App Store

1.认识miniconda
2.下载miniconda

二、miniconda的安装、配置

1.怎么安装miniconda
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh

2.激活
source ~/.bashrc

3.镜像
# 使用清华镜像# conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda conda config --set show_channel_urls yes

三、miniconda的使用

1.查看当前所有软件列表
conda list
2.搜索软件
conda search fastqc
3.安装软件
conda install fastqc -y
4.卸载软件
conda remove fastqc -y
#注：-y表示自动安装

四、conda环境

1.查看当前有哪些环境
conda info --envs
#注前面带*是默认
2.创建rnaseq安装fastqc、trimmomatic生信软件
conda create -n rna-seq python=3 fastqc trimmomatic -y
3.检查软件环境是否搭建好
conda info --envs
4.激活rna-seq环境
conda activate rna-seq

五、卸载安装上的conda重新再来一遍

rm -r biosoft 

• 重新再来一遍孰能生巧
• 报错了主动查找原因
• 不灰心，不放弃