修改PGA，让你的叶绿体gb文件不再有问题

很多人会使用PGA进行叶绿体基因组注释，但是PGA产生的genbank文件不够规范，对其进行以下修改，能解决很多问题：

vi PGA.pl

2078行开始改
        my $num_blank=20-length($filename);
        my $my_blank=" "x$num_blank ;
        print $out_annotation "LOCUS       $filename $my_blank $length_cp bp    DNA     $type PLN $time"."\n";

修改前

修改后

用修改后的PGA.pl产生的gb文件
==> output1/sequence.gb <==
LOCUS       sequence              160301 bp    DNA     circular PLN 13-APR-2021

用修改前的PGA.pl产生的gb文件
==> output2/sequence.gb <==
LOCUS       sequence  160301 bp    DNA     circular PLN 13-APR-2021

差别主要在第一行，修改后的才是符合标准的