数据分析3.1-stringtie 注释新基因-鉴定lncRNA

stringtie -p 16 -G /apps/users/zebrafish/Danio_rerio/pkd2/Danio_rerio.GRCz11.102.gtf  –B -A -o WT_30_1.Dr102.stringtie.gtf -l W3_first wt_30_1Aligned.sortedByCoord.out.bam

Error: input file –e cannot be found!

Aborted (core dumped)

-e选项是只组装参考基因组里有的,不进行新基因的预测,提高组装速度。为什么呢能用呢?

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