小组学习DAY6-ZZW

内容来自生信星球

R包与小抄

安装R包

  • install.packages("R包")
  • 直到出现<，表示安装成功
    可能出现的问题：
    1.换一个镜像

    方法

加载R包

  • library(R包)

关于数据框

1.新建数据框
a<-data.frame(GeneId = rep("gene5",times=3),SampleName =paste("Sample",1:3,sep=""),Expression=c(14,19,18))

  • rep，重复，括号中填要重复的字符和重复次数。
  • paste，连接两个字符串，括号要填两个代连接字符并指定分隔符（sep），没有分隔符就填sep=“”。
  • 1：3表示从1到三。如需一列中需要填入三个无规律的数字，可以用向量c(1，3，4)，同样如果填的是字符串也需要加双引号，例如c("doudou","huahua","xiaoyu")。
  • 了解概念：key-value--“键值对” ，表示一种对应关系。“键”和“值”都是列名，如SampleName和Expression的对应
    括号里是“列名”=列值，这里列名要加双引号
    得到的数据框

    实际操作

tidydata

  • 一种组织表格数据的方式
  • 提供了一种能够跨包使用的“统一”的数据格式

  • 什么叫“统一”？
    每个变量（variable）占一列，每个情况（case）和观测值（observation）占一行


    处理前

    处理后

    1.Reshape Data
    2.Handle Missing Values

  1. Expand Tables

思维导图


R包使用.png
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