空间组学(Spatial Omics)技术在2022年被《Nature》杂志列为最值得关注的七大技术之一,被誉为“生命科学”的下一个风口。之前小编刚介绍了市场上较成熟的空间组学产品,其中包括10x Genomics的Visium平台。近期摩根大通(JP Morgan)会议上,10x Genomics又发布了升级版本Visium HD。
10x Genomics公司首席执行官Serge Saxonov在本周于摩根大通(JP Morgan)举行的医疗保健会议上重点介绍了公司的产品开发路线图,并详细介绍了公司产品组合即将取得的进展。在发言的最后,他宣布推出新的Visium HD系统,将现有Visium平台的分辨率从55微米光斑提高到2x2微米正方形,从而实现单细胞水平的分析。新系统现已开始接受订购,旨在满足客户对更高分辨率Visium产品的需求。

10x Genomics宣布他们已经出货了500台Visium CytAssist仪器,这为除了Xenium之外的Visium HD奠定了基础。

现有的10x Visium空间转录组捕获区域6.5x6.5mm、spot数量约5000个、spot直径 55µm、分辨率100µm、支持HE染色。而新发布的Visium HD平台将直径 55µm直径的圆形区域改成了2x2µm的正方形,数目也从5千个spot大幅提升到1100万个squares,并且正方形之间没有缺少探针的真空地带,实现了NO GAPs。


从图中我们可以直观的看到升级后的Visium HD的数据,不再是一个个圆点组成的区域,而是更为密集且充满整个组织区域的表达图谱,这将解决10x Genomics平台一直被诟病的分辨率不足的问题,真正可以达到单个细胞的分辨率。


Visium HD将在24年一季度发货,对于已经拥有CytAssist的人来说,他们只需要预订芯片和相关套件进行升级。

10x Genomics也展示了他们总体的产品策略:继续用更高的分辨率和更高的通量来淘汰旧的遗留技术。单细胞转录组(Chromium平台)现在可以实现每个细胞数千个转录本的捕获测序,这是下一代测序技术(Next-generation sequencing)在细胞分辨率上的更进一步。另一个是原位技术(Xenium平台)可以在高分辨率下完成大型图像绘制。

现在10x Genomics的第三个支柱是Visium HD,它实现了在空间转录组水平的第三条产品线。10x Genomics强调产品的互补性,辅以软件集成,它允许研究人员在所有3个平台上无缝地观察给定样本的可比数据点。