甲基化是表观遗传的一种。表观遗传，是研究DNA序列以外的遗传效应改变的学科。
物竞天择，适者生存，性状遗传，表观调控。
甲基化分为：DNA甲基化和组蛋白甲基化。
DNA甲基化：在DNA甲基转移酶的作用下，将甲基选择性地添加到胞嘧啶上的过程，变成5-甲基胞嘧啶）。功能：调控基因表达，尤其在胚胎发育中控制着时序性表达的基因。相当于一种封印，在正确的时间，正确的解开和锁上很关键，否者可能生变。
三个重要概念：CpG岛，甲基化、去甲基化酶，甲基化特异性检测方法。
CpG：富含CG序列的DNA区域。正常情况下，属于封印状态（甲基化修饰过的）。
而CpG岛，一般是非甲基化的，也就是解封印，是转录调控的开关。
启动子CpG岛甲基化后会诱发基因沉默，所以启动子CpG甲基化与转录活性呈负相关。
研究一个基因启动子甲基化就是找CpG岛的位置。
甲基化和去甲基化过程中发挥作用的酶和辅助蛋白因子：
甲基化是可逆的酶促反应，已知有4种：DNMT1、DNMT2、DNMT3a、DNMT3b。
分两类：
维持甲基化：Dnmt1为代表，作用于仅有一条链甲基化的DNA双链，使其完全甲基化，参与DNA复制双链中新和成链的甲基化。
从头甲基化：对DNA链甲基化状态的重构，不依赖于DNA复制，在完全非甲基化的位点上引入甲基。主要是Dnmt3a、Dnmt3b。
