Linux/超算中PBS常用命令

新手,纯纯搬运工【出处引用自:https://www.guanjihuan.com

1. Linux常用命令

最常用:

ls(英文全拼:list files):列出目录及文件名

ls -l:列出目录及文件名,可查看更多

ls -al:可以看到隐藏文件

cd(英文全拼:change directory):切换目录

cd .. :返回上一级

cd 文件夹名:进入目录

pwd(英文全拼:print work directory):显示目前的目录

mkdir 文件夹名(英文全拼:make directory):创建一个新的目录

rmdir 文件夹名(英文全拼:remove directory):删除一个空的目录

cp xxx xxx(英文全拼:copy file): 复制文件或目录

mv xxx xxx(英文全拼:move file): 移动文件或目录,或修改文件或目录的名称

rm(英文全拼:remove): 删除文件

rm -r 文件夹名:递归删除某目录

clear:清空terminal的所有内容(或者使用Ctrl+L)

tab按键:补充完整文件名或文件夹名

次常用:

vim/vi 某文件 (编辑文件)

nano 某文件 (编辑文件)

touch 文件 (新建空文件)

sudo -s (切换到root模式)

exit (退出root模式等)

sudo chmod -R 755 文件名/文件夹名 (获取文件/文件夹的755权限)

chown [用户] [文件或目录] (改变文件或目录的所有者)

chgrp [用户组] [文件或目录] (改变文件或目录的所属组)

make (编译成.exe)

解压/解包:

tar文件 (注:tar是打包,不是压缩!)

解包:tar xvf FileName.tar

打包:tar cvf FileName.tar DirName

.gz文件

解压1:gunzip FileName.gz

解压2:gzip -d FileName.gz

压缩:gzip FileName

.tar.gz 和 .tgz文件

解压:tar zxvf FileName.tar.gz

压缩:tar zcvf FileName.tar.gz DirName

安装和卸载deb软件包:

安装:sudo dpkg -i deb文件

查看:sudo dpkg -l

卸载:sudo dpkg -r 软件名

参考资料:

[1] Linux 教程

[2] Linux常用命令

[3] linux中tar命令的用法

[4] 全网最全Linux命令总结

2. vim/vi里的操作

:q 退出

:wq 保存并退出

:w 保存

:q! 强行退出(不保存退出)

:w! 强行保存

i 进入编辑,转为输入模式(光标前面)

a 进入编辑,转为输入模式(光标后面)

o 进入编辑,转为输入模式(光标下方新建一行)

Esc 退出i(插入)命令

3. 超算中PBS常用命令

pbsnodes (查看所有节点)

pbsnodes -l free (查看空闲节点)

pbsnodes 某节点 (查看某节点状态)

ssh 某节点 (转到某节点)

exit (离开节点)

qsub 文件名.pbs/sh (提交任务)

qstat (列出状态)

qstat -q (列出队列)

qstat -n (列出队列中使用的节点)

qstat -f jobid (查看jobid任务的详细信息)

qdel jobid (取消任务)

4. 其他

(1)Linux开机自启

sh文件中包含:

#!/bin/bash#chkconfig: 2345 80 90#description:auto_run

sh文件移动到/etc/init.d后,分别输入命令:

chkconfig --add xxx.sh

chkconfig --list   

chkconfig xxx.sh on 

service xxx.sh start

参考资料:linux 开机启动 .sh 文件 - 自己的太阳 - 博客园

(2)Linux环境变量

方法1:临时使用环境变量:export PATH="/home/www/anaconda3/bin:$PATH"

方法2:修改.bashrc文件

参考资料:Linux PATH 作用以及查看和修改方法_haozhepeng的专栏

(3)两个sh文件

a.sh文件(用于提交任务,执行a.py文件)

#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1python a.py

a.sh文件(用于提交任务,执行a.exe文件)

#!/bin/sh#PBS -N task#PBS -l nodes=1:ppn=1#PBS -q scorecd $PBS_O_WORKDIRexport OMP_NUM_THREADS=1./a.exe

(4)一个makefile文件

makefile文件(用于编译Fortran文件)

INC := -I/public/software/compiler/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/include/intel64/lp64

LIB := -L/public/software/compiler/intel/composer_xe_2015.2.164/mkl/lib/intel64

mpi:= -I/public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/include /public/software/mpi/mpich/3.1.4/intel/lib -lmpich -limf -lsvml -lintlc

src:=Console1exec:=a

all: $(src).f90

ifort  $(src).f90  $(INC) $(LIB) -openmp -lmkl_intel_lp64 -Wl,--start-group -lmkl_intel_thread -lmkl_lapack95_lp64 -lmkl_core -lmkl_blas95_lp64  -Wl,--end-group -liomp5 -lpthread -O2 -o $(exec).exe

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