NHANES数据库介绍及使用(六)-几步学会回归

在繁杂的现场工作中找到片刻闲暇时间,加之最近又有读者问起,便继续更新之前的教程,希望能对大家有所帮助。本次主要分享的是线性回归以及logistic回归的内容~

1. 线性回归
按以往惯例,还是以官方教程提供的数据和代码为参考,采用的dataset与之前教程一致,就不再放链接了,直接上代码和结果

  • SAS代码 (主要就是变量的重新赋值,为之后校正混杂因素等做好准备)
data analysis_data_1;  
set analysis_data;
if ridstatr=2; *all mec exam data;

/*set don't know and refused (7,9) to missing*/
if dmdeduc>3 then dmdeduc=.;

/*define smokers*/
if smq020 eq 2 then smoker=1;
else if smq020 eq 1 and smq040 eq 3 then smoker=2;
else if smq020 eq 1 and smq040 in(1,2) then smoker=3;

/*for input to SAS PROC SURVEYREG - recode gender so that men is the reference group*/
if riagendr eq 1 then sex=2;
else if riagendr eq 2 then sex=1;

/*for input to SAS PROC SURVEYREG - recode race/ethnicity so that non-Hispanic white is the reference group*/
ethn=ridreth1;
if ridreth1 eq 3 then ethn=5;
else if ridreth1 eq 4 then ethn=2;
else if ridreth1 eq 2 then ethn=3;
else if ridreth1 eq 5 then ethn=4;

if 0 le bmxbmi lt 18.5 then bmicatf=1; 
else if 18.5 le bmxbmi lt 25 then bmicatf=4; 
else if 25 le bmxbmi lt 30 then bmicatf=2; 
else if bmxbmi ge 30 then bmicatf=3; 

if 0 le bmxbmi lt 18.5 then bmicat=1; 
else if 18.5 le bmxbmi lt 25 then bmicat=2; 
else if 25 le bmxbmi lt 30 then bmicat=3; 
else if bmxbmi ge 30 then bmicat=4; 

if (lbdhdl^=. and riagendr^=. and  ridreth1^=. and smoker^=. and dmdeduc^=. and bmxbmi^=.)and wtmec4yr>0
   and (ridageyr>=20) then eligible=1;  *else eligible=2;

run;
  • SAS代码 (简单线性回归以及多元线性回归)
/*简单线性回归*/
PROC SURVEYREG data=analysis_data_1 nomcar;
STRATA sdmvstra;
CLUSTER sdmvpsu;
WEIGHT wtmec4yr;
MODEL  lbdhdl= bmxbmi/CLPARM  vadjust=none;
DOMAIN eligible;
run; 
/*多元线性回归*/
PROC SURVEYREG data=analysis_data_1 nomcar;
STRATA sdmvstra;
CLUSTER sdmvpsu;
WEIGHT wtmec4yr;
CLASS  sex ethn smoker dmdeduc bmicatf;
DOMAIN eligible;
MODEL  lbdhdl= sex ethn ridageyr smoker dmdeduc smoker bmicatf/CLPARM solution vadjust=none;
run; 
  • 结果展示


    简单线性回归结果

    多元线性回归结果

2.logistic回归

  • SAS代码 (主要就是变量的重新赋值,为之后校正混杂因素等做好准备)
data analysis_data_1;
    set analysis_data;
    if ridstatr=2; *all mec examined data;

   if ridageyr >= 20 then sel=1; *else sel=2;

*create an indicator of hypertension based on blood pressure and medication;
    if (bpxsar >= 140 or bpxdar >= 90 or bpq050a = 1) then Hyper = 1;
    else if (bpxsar ne . and bpxdar ne .) then Hyper = 0;

*create an indicator of high cholesterol based on total cholesterol and medication;
    if (lbxtc>=240 or bpq100d = 1) then HiChol = 1;
    else if (lbxtc ne . ) then HiChol = 0;

    *create bmi groups;
    if 0<=bmxbmi<25 then bmigrp=1;
    else if 25<=bmxbmi<30 then bmigrp=2;
    else if bmxbmi>=30 then bmigrp=3;

    *create age groups;
    if 20<=ridageyr<40 then age=1;
    else if 40<=ridageyr<60 then age=2;
    else if ridageyr>=60 then age=3;

    *create log of fasting triglycerides;
    logtrig=log(lbxtr);

run;
  • SAS代码 (多元logistic回归)
PROC SURVEYLOGISTIC DATA = Analysis_Data_1 nomcar; /* can add "noprint" option to suppress printing if using ods statement*/
STRATA sdmvstra;
CLUSTER sdmvpsu;
WEIGHT wtsaf4yr;
DOMAIN  sel;
CLASS age (PARAM=REF REF="2") 
      riagendr (PARAM=REF REF="2") 
      hichol (PARAM=REF REF="1") 
      bmigrp (PARAM=REF REF="2"); /*分别以2组和1组作为对照组*/
MODEL hyper (desc)=age riagendr hichol bmigrp logtrig/clparm vadjust=none;
run;
  • 结果展示


  • 一点总结
    总体而言,演示程序并不复杂,完成前期的赋值,之后带入模型即可。但是程序中仍有可学习的地方,比如是否患高血压的赋值,满足收缩压>140mmHg或者舒张压>90mmHg或者服用高血压药物;通过lbdhdl^=.来排除缺失值,筛选最后需要的人群


4. 参考内容

https://wwwn.cdc.gov/nchs/nhanes/tutorials/samplecode.aspx

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
  • 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解...
    沈念sama阅读 204,293评论 6 478
  • 序言:滨河连续发生了三起死亡事件,死亡现场离奇诡异,居然都是意外死亡,警方通过查阅死者的电脑和手机,发现死者居然都...
    沈念sama阅读 85,604评论 2 381
  • 文/潘晓璐 我一进店门,熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来,“玉大人,你说我怎么就摊上这事。” “怎么了?”我有些...
    开封第一讲书人阅读 150,958评论 0 337
  • 文/不坏的土叔 我叫张陵,是天一观的道长。 经常有香客问我,道长,这世上最难降的妖魔是什么? 我笑而不...
    开封第一讲书人阅读 54,729评论 1 277
  • 正文 为了忘掉前任,我火速办了婚礼,结果婚礼上,老公的妹妹穿的比我还像新娘。我一直安慰自己,他们只是感情好,可当我...
    茶点故事阅读 63,719评论 5 366
  • 文/花漫 我一把揭开白布。 她就那样静静地躺着,像睡着了一般。 火红的嫁衣衬着肌肤如雪。 梳的纹丝不乱的头发上,一...
    开封第一讲书人阅读 48,630评论 1 281
  • 那天,我揣着相机与录音,去河边找鬼。 笑死,一个胖子当着我的面吹牛,可吹牛的内容都是我干的。 我是一名探鬼主播,决...
    沈念sama阅读 38,000评论 3 397
  • 文/苍兰香墨 我猛地睁开眼,长吁一口气:“原来是场噩梦啊……” “哼!你这毒妇竟也来了?” 一声冷哼从身侧响起,我...
    开封第一讲书人阅读 36,665评论 0 258
  • 序言:老挝万荣一对情侣失踪,失踪者是张志新(化名)和其女友刘颖,没想到半个月后,有当地人在树林里发现了一具尸体,经...
    沈念sama阅读 40,909评论 1 299
  • 正文 独居荒郊野岭守林人离奇死亡,尸身上长有42处带血的脓包…… 初始之章·张勋 以下内容为张勋视角 年9月15日...
    茶点故事阅读 35,646评论 2 321
  • 正文 我和宋清朗相恋三年,在试婚纱的时候发现自己被绿了。 大学时的朋友给我发了我未婚夫和他白月光在一起吃饭的照片。...
    茶点故事阅读 37,726评论 1 330
  • 序言:一个原本活蹦乱跳的男人离奇死亡,死状恐怖,灵堂内的尸体忽然破棺而出,到底是诈尸还是另有隐情,我是刑警宁泽,带...
    沈念sama阅读 33,400评论 4 321
  • 正文 年R本政府宣布,位于F岛的核电站,受9级特大地震影响,放射性物质发生泄漏。R本人自食恶果不足惜,却给世界环境...
    茶点故事阅读 38,986评论 3 307
  • 文/蒙蒙 一、第九天 我趴在偏房一处隐蔽的房顶上张望。 院中可真热闹,春花似锦、人声如沸。这庄子的主人今日做“春日...
    开封第一讲书人阅读 29,959评论 0 19
  • 文/苍兰香墨 我抬头看了看天上的太阳。三九已至,却和暖如春,着一层夹袄步出监牢的瞬间,已是汗流浃背。 一阵脚步声响...
    开封第一讲书人阅读 31,197评论 1 260
  • 我被黑心中介骗来泰国打工, 没想到刚下飞机就差点儿被人妖公主榨干…… 1. 我叫王不留,地道东北人。 一个月前我还...
    沈念sama阅读 44,996评论 2 349
  • 正文 我出身青楼,却偏偏与公主长得像,于是被迫代替她去往敌国和亲。 传闻我的和亲对象是个残疾皇子,可洞房花烛夜当晚...
    茶点故事阅读 42,481评论 2 342