学习小组day7--王珊

Fastq

Fastq.png

Fastq文件→Fasta文件
Linux命令
法1：sed '/^@/!d;s//>/;N' your.fastq > your.fasta
法2：seqtk seq -A input.fastq > output.fasta

FASTX-Toolkit
用于处理Short-Reads FASTA/FASTQ文件的程序，里面包含了丰富的Fasta/Fastq文件格式转换、统计等命令。
http://hannonlab.cshl.edu/fastx_toolkit/

EMBL → Fasta格式转换（在线工具）：
http://www.geneinfinity.org/sms/sms_embltofasta.html

各类文件格式说明
https://genome.ucsc.edu/FAQ/FAQformat.html

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