2023-04-20 细胞器的marker

需要对细胞器进行分离,查了一些资料,比较好看,贴上来。

1. Thermo

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海报:细胞器标记物抗体和细胞染色剂

2. CST

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3.优宁维对指标的解释

01、细胞核nucleus

细胞核作为最早发现的细胞器,是存在于真核细胞中的封闭式膜状胞器,内部含有细胞中大多数的遗传物质与多种蛋白质。是细胞增殖、分化、代谢等活动中关键环节之一,所以也就成为了大家研究之重地。

其结构包括核被膜,染色质,核仁与核基质四部分。小伙伴们可能根据需要会染出其中某些结构,例如承担合成核糖体作用的核仁,或者核膜等,也有可能需要染出整个细胞核。下表是一些细胞核结构常用marker。

细胞器

Marker

细胞核 nucleus

ASH2L ; ESET ; Histone H2A; LSD1;

核仁nucleolus

eIF6; Fibrillarin

核被膜 nuclear envelope

Lamin A/C; NUP98

着丝粒 centromeres

CENP-A

但如果研究细胞分裂期,细胞核已经解体的情况下,需要染染色体和着丝粒,一般可选用Aurora A/B/C ; Phospho-AuroraA (Thr288)/Aurora B (Thr232)/Aurora C (Thr198); Phospho-CENP-A(Ser 7); Phospho-HistoneH3(Ser10)这种在分裂期的marker。

02、内质网 Endoplasmic Reticulum

PDI ; ERp72

内质网(ER)是分泌蛋白进行翻译后修饰和正确折叠的过程的场所。为了获得分泌蛋白的天然构象,许多分泌蛋白需要形成分子内或分子间二硫键。

这个过程叫做氧化蛋白质折叠,是需要蛋白质二硫键异构酶(PDI)催化这些二硫键的形成和异构化。ER应激蛋白72(ERp72)是PDI家族的成员。

所以一般情况下我们可以用Erp72,PDI做为内质网的蛋白marker。

03、线粒体 Mitochondria

AIF; COX IV; Hexokinase;

凋亡诱导因子(AIF,pdcd8)是一种广泛表达的蛋白,在Caspase非依赖性细胞凋亡中起着重要的作用。AIF通常定位于线粒体膜间隙,可以作为线粒体的marker。

细胞色素c氧化酶(COX)是是呼吸链末端的酶复合体,由13个亚单位组成,定位于线粒体内膜。COX IV是其亚基之一,可以作为线粒体的marker,也可以用作研究细胞线粒体凋亡调控。

己糖激酶(Hexokinase)有5种亚型,其中I和II分布在线粒体外膜,与电压依赖性阳离子通道蛋白结合,这种部位让己糖激酶能直接获得线粒体产生的ATP,ATP是己糖激酶的底物之一。

癌细胞高水平己糖激酶被认为是驱动糖酵解维持细胞无氧代谢的表现,这就是德国著名科学家Otto Heinrich Warburg 1930年提出的著名假说Warburg效应。另外,Hexokinase也可作为线粒体的marker之一。

04、高尔基体 Golgi

RCAS1; Syntaxin 6

受体结合肿瘤抗原(RCAS1)是一种III型跨膜高尔基体蛋白,通常作为肿瘤的一个阳性表达率存在的一种蛋白靶点,在很多的癌症检测中都存在这个指标,并且主要是特异性地定位于内质网-高尔基中间腔室和顺面高尔基网,所以通常可以作为高尔基体的marker。

突触融合蛋白6(Syntaxin 6),它主要发现于高尔基体并参与胞内囊泡的输送,所以通常可以作为高尔基体的marker。

05、溶酶体 Lysosome

LAMP1:LAMP2

溶酶体相关膜蛋白1和2(LAMP1: LAMP2)是溶酶体膜的组成部分,因此构成了极佳的溶酶体标志物,以此来作为溶酶体的maker再合适不过。

参考资料

1.细胞器常用蛋白marker全攻略(上)

  1. 海报:细胞器标记物抗体和细胞染色剂
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