AmyTree算法

1. input要求:四个文件,Y-SNP基因型, 树文件, 编译名称文件,参考序列

2.  Call Quality test:高质量则用ref+变异一起做分析,低质量则用变异做分析

3. Y-SNP来判断个个节点的状态: 高质量时,match 85%为true, 低质量时,match 5%为true

4.V算法: return所有叶子节点是True的情况

5. h算法:return节点,这些节点没有自节点为True,或已经到了叶节点

6.c算法:只有叶子节点的祖先节点在h算法中被return了,才保留

7.s算法:如果C算法中还有多个,则报告最深度的叶节点

最后编辑于
©著作权归作者所有,转载或内容合作请联系作者
平台声明:文章内容(如有图片或视频亦包括在内)由作者上传并发布,文章内容仅代表作者本人观点,简书系信息发布平台,仅提供信息存储服务。

推荐阅读更多精彩内容

  • Spring Cloud为开发人员提供了快速构建分布式系统中一些常见模式的工具(例如配置管理,服务发现,断路器,智...
    卡卡罗2017阅读 135,083评论 19 139
  • 背景 一年多以前我在知乎上答了有关LeetCode的问题, 分享了一些自己做题目的经验。 张土汪:刷leetcod...
    土汪阅读 12,788评论 0 33
  • 今天和我哥一起去看了这部电影。说实话有很高的期待,因为毕竟是猴年,前些日子六小龄童上春晚的事情又闹得沸沸扬扬,在这...
    阿菊啊_阅读 290评论 0 0
  • 【七月未央】20170715学习力6期践行D61 学习:复习了学习力第四课。 践行: 1.《手指谣》。指读了《小汽...
    七妈_haiyan阅读 568评论 0 51
  • 点击这里查看《我不勇敢》完整故事 第三章 面对人生的难 (四) 第二天孟小北早早的到了肿瘤医院。孟小北从小就不喜欢...
    孟小北阅读 247评论 0 0