isoseq3官网:但是后面有polish这一步
IsoSeq/isoseq-clustering.md at master · PacificBiosciences/IsoSeq · GitHub
IsoSeq_SA3nUP
比上面的pipeline更为简洁,并且对后续分析有交待。
另一个参考的pipeline:https://ucdavis-bioinformatics-training.github.io/2020-september-isoseq/liz/bioconda/2-bioconda