specfem2d安装与测试

specfem2d是做地震模拟常用软件,安装较为简单,但只能在Linux系统上使用!

系统:ubuntu16.04

辅助工具:git

说明:git已经是Linux系统默认自带的,这很方便($ git 可以验证是否自带)



有了git后下面具体介绍specfem2d软件的安装流程:

步骤1:使用git从github上下载specfem2d的最新版本

命令:$ git clone --recursive --branch devel https://github.com/geodynamics/specfem2d.git

注意:选择branch为devel

说明1:在华为云服务器上用git下载速度非常的快!但是在自己电脑的虚拟机上下载网速有限,需等待!

说明2:下载的是原始完整程序,无需解压操作。

步骤2:进入specfem2d文件夹,为软件条件c++和fortran的编译器

命令:$ ./configure FC=gfortran CC=gcc

说明1:gcc所有linux自带,gfortran可能不自带,安装十分简单不累述;

说明2:在官方的教程中,此句还可以添加mpi并行计算的编译器

命令:$ ./configure FC=gfortran CC=gcc MPIFC=mpif90 --with-mpi

步骤3:安装

命令:$ make

说明1:安装之后所有的可执行程序都在bin文件夹中(原来该文件夹是空的)

至此,specfem2d软件安装完毕!

步骤4:测试,bin文件夹下的两个可执行程序(shell脚本)

命令1:$ ./bin/xmeshfem2D

命令2:$ ./bin/xspecfem2D

说明:如果终端出现大量的计算过程,说明安装成功!

至此,specfem2d已可以正常使用! have fun~



成功安装好软件好,下面进行简单的使用:

在EXAMPLES文件夹中有很多“功能(shell脚本)”,我们测试一个“自由界面的平面波”模拟!

步骤1:首先在EXAMPLES文件夹中找到initial_plane_wave_with_free_surface子文件夹并进入

命令:$ cd ./EXAMPLES/initial_plane_wave_with_free_surface

步骤2:用任何编辑器均可修改Par_file文件中的参数!将其中NPROC改为1,initialfield改为false;保存并退出

命令:$ vi Par_file

步骤3:运行shell脚本(模拟开始)

命令:$ ./run_this_example.sh

结果:会生成DATA和OUTPUT_FILES这两个文件夹,其中OUTPUT_FILES是模拟的结果(一大堆图像文件)

说明1:.jpg文件波场快照,看图像内容即可知道

说明2:OUTPUT_FILES文件夹中有很多*.semd文件,这些文件是生成的地震记录;

我们希望把这些地震记录文件转成sac可以识别的,这里需要借助前人写好的一个python程序!

地址:https://gitlab.com/ranor/specfem2d/blob/master/get-sac-from-semd.py

文件格式转换命令:$ python3 get-sac-from-semd.py semd

转换结果:OUTPUT_FILES文件夹中会生成一大堆*.SAC的文件,说明转换成功!



对get-sac-from-semd.py文件的补充说明:

说明1:说明的模块都改到python3+的版本下操作,上面网址中也有说明,但是是在python2.7下操作的!

说明2:首先把该python文件中所要用的模块都安装好,其中obspy是第三方的地震处理模块,安装如下

命令:$ sudo pip3 install obspy

说明3:注意说明1!使用命令一定是:$ python3 get-sac-from-semd.py semd

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