新手帮助
(1)R的赋值符号不是等号,而是<-
(2)在Console 控制台输入命令,相当于Linux的命令行
(3)R的代码都是带括号的,括号必须是英文的。
(4)显示工作路径 getwd()
(5)向量是由元素组成的,元素可以是数字或者字符串。
(6)表格在R语言中改名叫数据框_
(7)别只复制代码,要理解其中的命令、函数的意思。函数或者命令不会用时,除了百度/谷歌搜索以外,用这个命令查看帮助:?read.table,调出对应的帮助文档,翻到example部分研究一下。
1.标量和向量的区分
首先明确“元素”的意思,元素指的是数字或者字符串(用chr表示)等,根据它可以区分两个词:
标量:一个元素组成的变量
向量:多个元素组成的变量
(补充:一个向量是一排有序排列的元素,以后会用到把一个向量作为数据框中的一列的情况。)
理解元素、向量和标量
使用时,一般都会直接给变量定义,也就是“赋值”,字面意思是赋予这个变量一个数值(其实也不一定是数值,还可以是字符串/数据框等等)。
2.从向量中提取元素
1)根据元素位置
这里的x是你刚才赋值的变量名,根据自己的情况来修改
x[4] #x第4个元素
x[-4]#排除法,除了第4个元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4个元素
x[-(2:4)]#除了第2-4个元素
x[c(1,5)] #第1个和第5个元素
(2)根据值
x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
Part2:数据框
将示例数据放在你的工作目录下(!!!重要)
示例数据是如何获得的?(可跳过)
(1)新建doudou.txt,输入以下(如果教程里让你新建,又没说在哪里,你就默认在工作目录下新建。)
X1,X2
A,1
B,
C,
D,3
E,
小抄截图中显示的NA表示空值,所以新建的时候像我一样空着就好。用以下命令即可获得示例数据框:
X<-read.csv('doudou.txt')
(1)读取本地数据
(huahua.txt在示例数据里有,记得一定要放在工作目录里,否则报错。)
sep,header是比较常用的参数,可以看帮助文档尝试理解它们的意思
(2)设置行名和列名
X<-read.csv('doudou.txt') #在示例数据里有doudou.txt 注意这里的变量X是一个数据框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默认值的行名就是行号,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回数据,左上角第一格为空,R会自动补为x,用这个命令来修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列为行名
(3)数据框的导出
write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改为逗号,字符串不加双引号(默认格式带由双引号)
(4)变量的保存与重新加载
这次没有处理完的数据下次想接着用怎么办?--学会保存和重新加载。保存的格式是RData。
save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存当前所有变量
save(X,file="test.RData")#保存其中一个变量
load("test.RData")#再次使用RData时的加载命令
(5)提取元素
- X[x,y]#第x行第y列
- X[x,]#第x行
- X[,y]#第y列
- X[y] #也是第y列
- X[a:b]#第a列到第b列
- X[c(a,b)]#第a列和第b列
- X$列名#也可以提取列(优秀写法,而且这个命令还优秀到不用写括号的地步,并且支持Tab自动补全哦,不过只能提取一列)
(6)【选修部分】直接使用数据框中的变量
需要提示一下,这里的case和values是两个单纯的列名,没别的意思
options(stringsAsFactors = T)
a <-data.frame(case=paste0("S",1:9),values=runif(9))
plot(avalues)
--这种方法有个缺点:数据框名a在代码中重复出现(不符合懒惰(哦不,高效)的要求)
这里地数据框名比较简短,可能你看不出不够优雅,本着花花懒惰的强迫症精神,不能允许数据框名出现两次。
save(X,file="test.RData")这句代码如果报错object X not found,是为什么,应该怎么解决?
1.X的大小写是否一致;2.file中是否有X数据的存在。应当检查数据是否有误,数据及代码中的X大小写是否一致。