第1篇：ATAC-seq的背景介绍以及与ChIP-Seq的异同
第2篇：原始数据的质控、比对和过滤
第3篇：用MACS2软件call peaks
第4篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（一）——phantompeakqualtools
第5篇：对ATAC-Seq/ChIP-seq的质量评估（二）——ChIPQC
第6篇：重复样本的处理——IDR
第7篇：用Y叔的ChIPseeker对peaks进行注释和可视化
第8篇：用网页版工具做功能分析和motif分析
第9篇：差异peaks分析——DiffBind
第10篇：ATAC-Seq、ChIP-Seq、RNA-Seq整合分析
简书·六六_ryx· 的学习笔记汇总（方便学习）
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