生信入门学习笔记 day2@2021.6.27

Linux入门

生信分析需要借住软件,软件运行需要平台/操作系统,常用的如win、mac,图形界面占据大量运行资源。Linux系统因其代码操作,直接调用等因素,成为服务器首选操作平台。目前的生信分析软件也大多在Linux平台。

内容

  1. Linux服务器远程登录(win平台)
  • xshell使用——三要素:用户名、密码、网络


    Snipaste_2021-06-27_10-05-23.png
  1. 基本命令操作
  • pwd [print working directory 显示当前路径]


    pwd.png
  • mkdir [make directory 创建空目录]


    mkdir.png

    分别创建biomicrosoft、data、notebook、paper、result目录

  • ls [list files 用于显示指定工作目录下之内容]


    ls.png
  • rm [remove 用于删除一个文件或者目录]


    rm.png

    注意:文件一旦通过rm命令删除,则无法恢复,所以必须格外小心地使用该命令。
    -i 删除前逐一询问确认。
    -f 即使原档案属性设为唯读,亦直接删除,无需逐一确认。
    -r 将目录及以下之档案亦逐一删除。

  • cd [Change directory 接一个目录名,表示进入该目录]
    cd - 返回上次目录


    cd.png

    -vi /cat
    vi 新建脚本或者文本文档,cat ,查看并直接将文本文件的内容输出到屏幕。


    vi cat.png
  • cp [copy 复制文件]


    cp.png

    -mv [move file 将文件移入文件夹,或者重命名]


    mv.png
  1. 总结


    linux.png
  2. 课后作业
    (1)ls输出的是横向的列表,怎样输出长格式列表。
    ls -l

    ls -l.png

(2) 如何查看长格式列表中文件的大小?
ls -lh

ls -lh.png

(2) 查看Linux系统版本、内存与硬盘空间?
lsb_release -a
lsb.png

free -m
free.png

df du
df.png

(3) 怎样建立类似/tmp/tmp1/tmp1.1 这样的层级目录
mkdir -p
mkdir-p.png

(4) 怎样删除这些层级目录
rm -rf
rm-rf.png

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