SCHISM 构建克隆进化树

SCHISM 的介绍

SCHISM是一款计算软件,主要用于推断亚克隆层次结构和肿瘤体细胞突变的演化,推理过程涉及肿瘤烟花的两个基本属性的计算评估,1是谱系优先规则,2是谱系分歧规则

SCHISM的分析包含两项主要内容:1 是基于体细胞突变细胞性(cellularity)信息,进行假设验证构建CPOV矩阵。 2 是进行适应度函数的遗传算法(GA)分析,探索树拓扑的空间并返回候选亚克隆发育树的优先列表

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