title: GDAS000-基因组数据分析系列笔记
date: 2019-09-01 12:0:00
type: "tags"
tags:
- Bioconductor
categories: - Genomics Data Analysis Series
前言
以前在网上看到了哈佛大学的PH525x系列课程，这个系列教程主要是生物信息学相关的内容，一共是17章。这17章内容可以大致分为三部分。
第一部分：第1章到10章主要是讲的与生物信息学有关的统计学基础，参考书是《Data Analysis for the life sciences》，第1章到第10章的笔记已经做完。
第二部分：第11章到第17章，涉及生物信息学的应用部分，例如Bioconductor上的几个包使用等，根据官网信息，这部分是《Genomics Data Analysis Series》，本来是想按照PH525x series - Biomedical Data Science 这个系列课程的目录来做笔记的，但是这里面的顺序并不太好，有部分重复，后来又发现了HarvardX Biomedical Data Science Open Online Training的课程目录，这个就比较友好了，里面有视频，也有代码。因此就按后者的顺序来做笔记。
第三部分：一些使用案例，内容是《Using Python for Research》，这个后面也会有笔记。
主要内容
基因组数据分析系列笔记主要分为以下几部分：
第一部分：Bioconductor介绍
这一部分涉及Bioconductor的基本情况，包括注释，基因组分析与基因分析（Introduction to Bioconductor: Annotation and Analysis of Genomes and Genomic Assays，注：我是区别不了Analysis of Genomes与Genomic Assays）。
