今天本打算看3个视频，结果应该是算看了2个，第二个没有看完，而第一个只是挑挑拣拣的看了一部分，可能第二个视频的内容太多了，每个新的知识点都需要我去延伸，虽然这只是对以前看过的东西的复习，但是可见以前看得有多么囫囵吞枣，很多内容都没有理解透彻。
1.就拿向量化循环来说，之前来来回回看了有2遍，都没有注意到这个概念，在r中，当对向量运算时，不需要写循环，自动对向量里面的每个值进行循环预算。
2.在r中的循环函数中，apply（a,1,function(x）{}), 老师说老老实实的记住就行了，其中1是对行进行循环计算，而2是对列进行循环计算，但是对于取矩阵中符合要求的行，比如：a[apply(a,1,function(x),sum(x)>floor(ncol(a)/50)),]，其中里面那个循环计算出来应该是每一排有一个逻辑值，那么a[x,y],x还可以是逻辑值？ 疑惑。
3.还有之前一直觉得CPM很复杂，一看到数学的计算公司就头疼，今天就像忽然醒悟一样，不就是稍微换算一下，把基因表达值除个reads数，再乘个一百万就可以了，去除了基因间的文库大小的差异。
4.看rpkm值也是，听老师讲了一下倒很懂，但是去发现网上有各种各样的定义，后来发现，只看一个定义实在是不好的，还是要多看看，综合去理解的，rpkm值既然是错误的，那么最好还是不用吧，但是我的那个数据一下载下来就是rpkm值，我也没办法。
5.至于spike-in和ERCC，也是标准化范畴里面的概念，spike-in就和housekeepinggene一样，是对基因表达数据进行标准化的，而ERCC，external rna control cortium，是spike-in里，
